Program S1 Fisika Matana University memiliki konsentrasi Fisika Medis yang mempersiapkan para lulusan untuk menjadi Fisikawan Medik, yaitu individu profesional yang mengaplikasikan ilmu fisika medis dalam bidang Radiodiagnostik, Radioterapi dan Kedokteran Nuklir di fasilitas kesehatan dan rumah sakit, lembaga regulasi/penelitian (BATAN/BAPETEN) dan di perguruan tinggi sebagai pendukung proses pengajaran/peneliti. Lulusan prodi Fisika Matana University juga dibekali dengan sertifikasi Petugas Proteksi Radiasi (PPR) yang dikeluarkan oleh Batan. Kurikulum yang digunakan di prodi S1 Fisika Matana University telah mengikuti standar yang ditetapkan oleh Himpunan Fisika Indonesia (HFI) dan Aliansi Institusi Pendidikan Fisika Medis Indonesia (AIPFMI).